Écart prévu dans la descendance : Que signifient tous ces chiffres ?
Il s’agit d’un article invité rédigé par Karin Schmid, spécialiste de la production de bœuf pour l’Alberta Beef Producers.
La saison des achats de taureaux est arrivée. Si votre maison ressemble à celle de ma famille, la plupart des surfaces disponibles sont maintenant encombrées de catalogues vantant les mérites du prochain grand reproducteur.
De nombreux facteurs jouent un rôle dans le choix d’un nouveau taureau pour votre exploitation (observation visuelle, race, généalogie, poids de naissance réel, ingestion alimentaire résiduelle (IAR), poids au sevrage, évaluation de l’aptitude à la reproduction, etc.), mais un outil qui peut aider à la sélection des reproducteurs a suscité beaucoup de confusion depuis sa première utilisation il y a plus de 40 ans. Décryptons cet outil précieux afin que vous puissiez évaluer de manière experte les reproducteurs potentiels lorsque vous feuilletez les catalogues de vente.
Définition de l’ÉPD
Les écarts prévus dans la descendance (ÉPD) sont des estimations de la valeur génétique d’un animal en tant que parent. Les ÉPD sont la différence entre la performance moyenne prévue de la future progéniture d’un animal et la performance moyenne de la progéniture d’un autre animal dont l’ÉPD est égal à zéro, en supposant que les taureaux soient accouplés à des vaches similaires, ou vice versa. Par exemple, si le taureau A a un ÉPD pour le poids de naissance de +9,0 lb et que le taureau B a un ÉPD pour le poids de naissance de +3,0 lb, cela signifie que les veaux du taureau A auront un poids de naissance supérieur de 6 lb au poids de naissance des veaux du taureau B, en moyenne.
Pour compenser les différences liées à l’environnement et à la gestion, des regroupements contemporains sont utilisés. Ces regroupements sont constitués d’animaux du même âge et du même sexe, élevés dans les mêmes conditions de gestion. Une fois ces facteurs pris en compte, la composante génétique est la partie qui reste, et c’est ce que les ÉPD prédisent. Les informations utilisées pour calculer les ÉPD comprennent la généalogie et les performances de l’animal individuel, de tous ses parents et de sa progéniture. On pense souvent que les ÉPD sont calculés de la même manière que les poids ajustés à 205 jours, mais ce n’est pas le cas. Pour calculer correctement les ÉPD, des millions d’équations doivent être résolues simultanément.
Il existe de nombreux ÉPD différents, allant de la facilité de vêlage et du poids au sevrage à la surface du faux-filet et au persillage, en passant par le poids et la longévité de la vache. Les ÉPD sont généralement exprimés dans les mêmes unités que les caractéristiques qu’ils mesurent (livres pour les caractéristiques de poids, pouces carrés pour la surface du faux-filet, etc.)
Différences entre les races
Chaque association de race publie différents ÉPD et indices, qui ne sont pas comparables entre eux, car les ÉPD de chaque race présentent des variations spécifiques dans la manière dont ils sont calculés. Un ÉPD Charolais de 72 livres pour le poids au sevrage n’a pas la même signification qu’un ÉPD Angus de 72 livres pour le poids au sevrage. En outre, les ÉPD moyens de la race ne sont pas nécessairement à zéro, de sorte qu’un ÉPD supérieur à zéro ne signifie pas nécessairement supérieur à la moyenne. C’est pourquoi il est important de connaître les chiffres moyens de la race qui vous intéresse. Certaines associations de race disposent d’évaluations génétiques couvrant plusieurs pays, afin de pouvoir comparer facilement la génétique d’un pays à l’autre. Certaines organisations produisent des ÉPD inter-races (par exemple, Beef Improvement Opportunities), qui peuvent être utiles dans certaines situations lorsque des taureaux de différentes races doivent être comparés.
Valeurs abstraites
Il est important de comprendre que les ÉPD ne permettent pas de prédire les performances individuelles des animaux et qu’ils ne correspondent pas à une valeur spécifique pour une caractéristique particulière. Un ÉPD de poids au sevrage de 46,6 lb ne correspond pas à un poids réel de 650 lb pour la progéniture de cet animal. Un ÉPD de poids au sevrage de 46,6 lb indique, qu’en moyenne, la progéniture de cet animal pèsera 46,6 lb de plus que la progéniture d’un animal différent avec un ÉPD de poids au sevrage de 0 lb (ou 20 lb de plus que la progéniture d’un animal différent avec un ÉPD de poids au sevrage de 26,6 lb).
Un taureau avec des ÉPD impressionnants ne garantit pas une production annuelle de veaux supérieure. Les producteurs se plaignent souvent que les ÉPD ne semblent pas refléter les données réelles. Étant donné que les ÉPD reposent sur les informations fournies par le producteur, il est essentiel de fournir des informations exactes. Cela signifie qu’il faut communiquer toutes les données de performance mesurées sur tous les animaux du troupeau et identifier correctement les groupements contemporains soumis à une gestion différente (comme l’alimentation à la dérobée). En outre, des milliards de descendants génétiquement différents peuvent naître d’un seul accouplement ! Il existe de nombreuses différences génétiques entre frères et sœurs. Étant donné que les ÉPD prédisent la performance moyenne de la progéniture, il est assez courant d’avoir un ou deux veaux qui ne s’intègrent pas au reste. C’est là que la précision entre en jeu.
Exactitude des prédictions
L’exactitude est une valeur comprise entre 0 et 1 qui reflète l’exactitude de la prédiction (ÉPD) par rapport à la véritable valeur génétique (valeur reproductive) de l’animal. Les valeurs d’exactitude augmentent à mesure que la quantité d’informations disponibles sur un animal augmente. Ajouter des données sur les performances propres d’un animal, les performances de ses proches et les performances de sa progéniture augmentera l’exactitude de la prédiction. Plus l’exactitude est grande, moins l’ÉPD est susceptible de changer de manière substantielle. Les associations de race disposent de tableaux de changements possibles, qui indiquent dans quelle mesure un ÉPD peut changer (à la hausse ou à la baisse) avec l’ajout de nouvelles informations. Les jeunes animaux ont généralement une faible exactitude, car l’association n’a pas encore enregistré d’informations sur la progéniture, tandis que les taureaux utilisés en insémination artificielle avec beaucoup de progéniture ont généralement des exactitudes assez élevées, ce qui indique une plus grande confiance dans les valeurs de l’ÉPD.
Certaines associations de race intègrent des données génomiques dans leurs évaluations d’ÉPD. En fusionnant les résultats des tests ADN avec les ÉPD traditionnels, il est possible d’ajouter plus d’informations à un âge plus jeune, ce qui augmente l’exactitude (et la confiance) dans les ÉPD de cet animal. Pour les caractéristiques à forte héritabilité, l’ajout de données génomiques peut augmenter l’exactitude de la même manière que l’ajout de données provenant de 7 à 20 descendants, si l’animal d’origine n’a que des données généalogiques.
Héritabilité : proportion de la variation d’une caractéristique particulière qui peut être attribuée à des facteurs génétiques héréditaires plutôt qu’à des facteurs environnementaux. Les caractéristiques de reproduction ont tendance à être faiblement héritables, tandis que les caractéristiques de poids et de carcasse le sont davantage.
Exemple
| Taureau A | Taureau B | |
|---|---|---|
| Veau #1 | 700 lbs | 625 lbs |
| Veau #2 | 600 lbs | 615 lbs |
| Veau #3 | 605 lbs | 650 lbs |
| Veau #4 | 610 lbs | 640 lbs |
| Poids moyen ajusté au sevrage | 628.8 | 632.5 |
| ÉPD du poids au sevrage du taureau | 51.7 (exactitude = 0.75) | 56.0 (exactitude = 0.75) |
La différence entre les ÉPD des deux taureaux pour le poids au sevrage est de 4,3 lb, ce qui est très proche de la différence entre les poids moyens ajustés au sevrage de leurs veaux dans l’exemple. Même si le taureau A a le veau avec le poids au sevrage le plus élevé, le reste de ses veaux montre que son ÉPD devrait être inférieur à l’ÉPD du taureau B. Les grands groupes contemporains et le grand nombre de descendants en général (ou les données génomiques dans certains cas) permettront d’obtenir un ÉPD qui reflète beaucoup plus fidèlement les données réelles.
Approche équilibrée de la sélection des caractéristiques
Un dernier point important est d’éviter la sélection basée sur une seule caractéristique ! Bien que tous ces chiffres puissent prêter à confusion, la sélection basée sur une seule caractéristique peut souvent entraîner des conséquences indésirables. Par exemple, sélectionner uniquement sur le poids au sevrage dans un système de production où les génisses sont conservées, conduira à des vaches adultes plus grandes, à des difficultés potentielles de vêlage et peut-être à une baisse de la fertilité. Une approche de sélection équilibrée, axée sur l’optimisation des caractéristiques en fonction de l’environnement et du système de production, donne de bien meilleurs résultats que la maximisation d’une seule caractéristique. De nombreuses races produisent des indices pour refléter un certain système de production (c.-à-d. terminal contre maternel) qui combinent les ÉPD économiquement pertinents pour ce système de production en un seul chiffre.
Les ÉPD sont le meilleur outil dont nous disposons pour estimer la valeur génétique d’un animal. Sur les jeunes animaux dont l’exactitude est faible, ils peuvent être utilisés pour restreindre les choix possibles de taureaux de troupeau en éliminant les taureaux dont les ÉPD sont les plus faibles, ou en choisissant entre quelques taureaux préférés. Sur les animaux plus précis, comme les taureaux d’I.A., où l’évaluation visuelle n’est souvent pas possible, ils peuvent être utilisés avec un degré de confiance raisonnable.
Pour plus d’informations :
- Associations de races (Conseil canadien des races de bovins de boucherie)
- Sire Selection Manual (Manuel sur la sélection des taureaux – en anglais seulement) (National Beef Cattle Evaluation Consortium)
- Using Expected Progeny Differences in a Breeding Program(Manitoba Agriculture)
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