Comprendre les modes de transmission de la grippe bovine et de la RAM chez les bovins en parc d'engraissement

Contexte

La grippe bovine est causée par des bactéries telles que Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida, Histophilus somni et Mycoplasma bovis. Ces bactéries sont naturellement présentes, parmi d’autres, dans les voies respiratoires des bovins. Chez un animal en bonne santé, le système immunitaire et les « bonnes » bactéries maintiennent sous contrôle les bactéries responsables de la grippe bovine. Cependant, lorsque les bovins sont soumis à un stress, les « bonnes » bactéries et le système immunitaire s’affaiblissent. Cela permet aux bactéries responsables de la grippe bovine de prendre le dessus, de pénétrer plus profondément dans les poumons et de rendre les animaux malades. Nous faisons de notre mieux avec nos connaissances et les moyens dont nous disposons, et dans le cas de la grippe bovine, nous utilisons des antibiotiques pour la traiter. Malheureusement, certaines bactéries résistantes aux antimicrobiens (RAM) peuvent survivre au traitement antibiotique. Elles se propagent également de manière contagieuse d’un animal à l’autre.

Ces chercheuses ont étudié si les souches pathogènes et résistantes de Mannheimia et de Pasteurella apparaissent indépendamment chez chaque animal, si elles se propagent d’un animal à l’autre, et dans quelle mesure ces deux facteurs pourraient jouer un rôle.

Objectifs

• Mieux comprendre dans quelle mesure la grippe bovine et la RAM apparaissent chez chaque veau individuellement, par rapport à la mesure dans laquelle elles se propagent de manière contagieuse d’un veau à l’autre.    

Ce qu’ils ont fait

Ce projet a utilisé des écouvillons nasopharyngés profonds prélevés sur 400 veaux achetés lors d’une vente aux enchères où les animaux sont triés à l’avance et placés dans des enclos adjacents au Livestock and Forage Center of Excellence de l’Université de la Saskatchewan (4 enclos de 100 veaux chacun). Les veaux de chaque enclos provenaient de 30 à 70 troupeaux différents. Ils ont été pris en charge conformément aux normes de l’industrie, vaccinés et traités à la tulathromycine (l’antibiotique présent dans les médicaments Draxxin, Increxxa, Lydaxx, Rexxolide, Tulamaxx, Tulaven, Tulinovet et Tulissin). Des écouvillons nasopharyngés ont été prélevés à l’arrivée, puis à nouveau deux et cinq semaines après l’arrivée. Mannheimia et Pasteurella, deux bactéries responsables de la grippe bovine, ont été isolées et conservées à partir de ces écouvillons. 

Leur objectif était de déterminer si les bactéries responsables de la grippe bovine pouvaient se propager de manière contagieuse d’un veau à l’autre au sein d’un enclos, ainsi qu’entre des enclos voisins. Les deux premiers enclos et les deux derniers partageaient une même source d’eau. Pour vérifier si les bactéries se propageaient de manière contagieuse, ils ont analysé les séquences d’ADN des bactéries afin de déterminer si elles étaient apparentées, et également pour vérifier si ces bactéries possédaient des gènes de résistance aux antibiotiques. Ils ont déterminé les séquences du génome complet de chaque isolat de Mannheimia prélevé sur les bovins de ces quatre enclos adjacents, ainsi que de chaque isolat de Pasteurella provenant de l’un des enclos.

Ce qu’ils ont appris

Mannheimia : À l’arrivée, 26 à 46 % des veaux étaient positifs à Mannheimia. Les chercheurs ont constaté une grande diversité génétique au sein des bactéries Mannheimia, mais peu de résistance aux antibiotiques. Deux semaines plus tard, la diversité génétique avait considérablement diminué. Au contraire, un groupe de Mannheimia étroitement apparentées dominait les isolats de chaque enclos. La diversité génétique limitée entre les bactéries de chaque enclos, observée plus tard au cours de la période d’engraissement, suggère que les bactéries se propageaient de manière contagieuse entre les animaux. Bien que la propagation se déroulait principalement au sein d’un même enclos, il y avait des raisons de croire que certaines souches de Mannheimia se propageaient également d’un enclos à l’autre. Les chercheuses ont également noté que les gènes de résistance aux antibiotiques étaient les plus fréquents deux semaines après l’arrivée. Cela pourrait être lié à l’antibiotique administré à l’arrivée, qui aurait favorisé la sélection de bactéries résistantes aux antibiotiques. 

Pasteurella : À l’arrivée, environ 44 % des veaux étaient positifs à la Pasteurella, et la diversité génétique de la bactérie était importante. Deux semaines plus tard, seuls 13 % des veaux étaient positifs à la Pasteurella, et la diversité génétique était également légèrement moindre. Les veaux qui étaient positifs à la bactérie aux deux moments présentaient généralement exactement la même souche à chaque fois. 

Ce que cela signifie

Mannheimia peut se propager de manière contagieuse. Bien qu’un traitement antimicrobien métaphylactique puisse contribuer à traiter la grippe bovine sous-jacente, il est possible que, dans certaines circonstances, il laisse derrière lui des bactéries porteuses de gènes de résistance aux antibiotiques. Ces souches peuvent proliférer, se propager et devenir la souche dominante de Mannheimia au sein de certains enclos. La faible diversité génétique observée chez les Mannheimia isolées à partir d’animaux individuels et de différents enclos suggère que la propagation contagieuse est probablement à l’origine de la prolifération de la RAM dans ce groupe d’enclos, plutôt qu’un développement indépendant de la RAM chez de nombreux animaux différents.

Pasteurella semble se comporter différemment. La plupart des veaux qui se sont révélés positifs aux deux moments n’ont pas changé de souche, ce qui signifie qu’ils n’ont pas « attrapé » de souches différentes de celles de leurs compagnons d’enclos. Le fait qu’il y ait eu moins de veaux positifs à Pasteurella lors de l’échantillonnage ultérieur pourrait indiquer que le médicament de métaphylaxie administré à l’arrivée a efficacement éliminé la bactérie.

Ces découvertes peuvent amener les éleveurs à repenser leur approche pour traiter la grippe bovine et pourraient encourager les vétérinaires à adapter leurs stratégies de prévention et de traitement de la maladie afin d’améliorer les résultats sanitaires et de réduire le risque de RAM.